海洋运载器导航技术研究所源于“哈军工”海道测量专业教研室，是国内唯一全面系统地从事海洋运载器导航理论及工程技术研究的高校科研机构。研究所形成“创新 求实 坚持 分享”的文化，现有教师44人，其中正高级职称16人，副高级职称21人，国家级人才6人。
研究所依托“导航、制导与控制”国家重点学科及“精密仪器及机械”博士授予权学科，拥有“导航仪器教育部工程研究中心”“先进导航与海洋智能装备技术国家地方联合工程研究中心”“船舶导航与控制工业和信息化部重点实验室”“黑龙江省导航仪器工程实验室”“黑龙江省高精度卫星导航及海洋应用重点实验室”。
研究所成功研制出具有国际先进水平的船用综合导航系统、电子航海图系统、光纤陀螺捷联惯性导航系统、高精度无线电导航系统、北斗海洋广域高精度增强定位系统、航行训练模拟器等高技术导航装备，代表国内该领域研究的最高水平。近五年，发表论文千余篇，获国家、省部级科技成果奖项10余项，授权国际专利、国家发明专利、国防专利70余项，入选国家级一流课程3门，获国家级教学成果二等奖1项，省教学成果特等奖4项。
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